E-R图的设计要依照上述抽象机制，对需求分析阶段所得到的数据进行分类、聚集和概括，确定实体、属性和联系。概念结构设计工作步骤包括：选择局部应用、逐一设计分E-R图和E-R图合并。
步骤 | 说明 | |
1 | 选择局部应用 | 通过数据流图理清数据。选择适当层次的数据流图（高层反映概貌太笼统，底层又过于细致无关联），让数据流图每个部分都对应一个局部应用（功能） |
2 | 设计分E-R图 | 对每个局部应用逐一设计分E-R图，又称局部E-R图。 从数据字典中提取数据，使用抽象机制，确定局部应用中的实体、属性、实体标识符及实体间联系及其类型。 事物是实体or属性：属性不可再分，属性不能与实体发生联系 |
3 | E-R图合并 | 通过合并过程解决分E-R图之间存在的冲突，消除信息冗余（相同实体合并，实体属性取并集） |
分E-R图合并时存在三类冲突： （1）属性冲突：同一属性在不同分E-R图中类型、取值范围、数据单位等可能会不一致 （2）命名冲突：相同意义的属性在不同分E-R图中命名不同，或者名称相同的属性在不同分E-R图中代表不同意义 （3）结构冲突：同一实体在不同分E-R图中有不同属性，同一对象在某分E-R图中被抽象为实体而在其他分E-R图中被抽象为属性 | ||
分E-R图合并时需对其优化 （1）实体类型合并：两个具有1：1联系或1：*联系的实体 （2）冗余属性消除：合并后的E-R图中的实体属性重复 （3）冗余联系的消除：实体联系存在环状结构 |